胚胎移植可以说是试管婴儿过程中，最后也是最重要的一步，在这个阶段，必须根据个别情况做好妥善的规划与各项准备，才能尽可能提升试管婴儿的成功率。
胚胎移植，可以分为以下3个阶段：
1、移植前期
在移植前，通常会通过B超检查来评估子宫内膜的容受性（receptivity of the endometrium），也就是确保子宫内膜对于胚胎的“接受能力”。
一般来说，子宫内膜厚度必须超过8毫米，同时通过超声波观察，子宫内膜与子宫基层紧密贴合，内膜结构达到所谓的“三线征”，可以明显看到三条线并列，就是比较适合胚胎在子宫里“安家”的时机。
此外，如果在B超检查时发现子宫内有任何可疑的异常情况，可能导致胚胎植入受到影响，例如息肉、子宫肌瘤，或阿舍曼综合征（子宫内黏连）等，建议立刻进行宫腔镜检查来进一步确认病症，并在胚胎移植前进行手术处理。
除了确保子宫环境适合移植，在这个阶段还有一件重要的事，就是选出最健康、最适合移植的胚胎，才能大幅提升移植成功率。
胚胎发育的过程
第1天：2PN原核期。观察受精卵是否呈现正常受精形态。
第2-3天：分裂期。此时，胚胎开始分解成2-10个细胞。
第4天：桑葚胚（morula）期。此时胚胎内已经分裂出大约多个簇状聚集细胞单元，从显微镜下看起来就像桑葚一般，甚至难以计算单个细胞的数量。
第5天：囊胚（blastocyst）期，或称胚泡期。这是胚胎发展的最后发展阶段。此时，胚胎从胚层中孵出，已经具备可以附着在子宫内膜上的能力。
并非所有的胚胎都能顺利分裂并发育到囊胚期。因此，耐心选择已发育为囊胚的胚胎来进行移植，会更容易成功着床。
然而，除了选择发展到第5天的囊胚进行移植可以增加怀孕成功几率外，针对胚胎进行染色体检查，可以更进一步地提高成功率。
主要原因是，不是所有的囊胚内都拥有正常的染色体。有些胚胎发育外观形状良好，但是如果胚胎染色体有异常，也会导致难以受孕成功，甚至是引发后续的流产，例如常见的萎缩卵（blighted ovum）或是死胎（FDIU）等，很多都是因为染色体异常造成。
3、移植后阶段
患者在移植后可以照常做各项例行检查。很多人可能会倾向卧床静养，但事实上，研究表明，一直躺在床上并不会增加怀孕成功率。唯一要注意的一点是，此时不要进行剧烈运动或高压的工作即可。
从以上胚胎移植的阶段来看，试管婴儿要能够成功，有许多决定因素，也和每个女性自身的情况而有所不同，更重要的是，这个过程需要经验丰富的辅助生殖医师，专业的胚胎师、高规格的胚胎实验室、与前沿的基因筛查等，都是迈向成功的重要推手。